昆明市档案馆成立于1959年8月，1997年机构改革，与昆明市档案局实行局馆合一体制；2002年机构改革中确定为合一体制，一个机构，两块牌子，为主管全市档案工作的市政府直属单位；2009年局(馆)整体实行参照公务员管理。2007年在全省率先晋升为云南省“五星级”综合档案馆，2009年在全省率先晋升为国家一级档案馆，成为西部第一批通过测评的国家综合档案馆之一。

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